El río Jalón y algunos de sus afluentes -Isuela y Aranda- se encajan fuertemente en los materiales sedimentarios mesozoicos. El predominio de la erosión vertical da lugar a valles estrechos y profundos cuyas laderas muestran series estratigráficas muy completas. Estos encajamientos, que dan lugar a desfiladeros en hoces, son frecuentes en las cabeceras de los ríos aunque también se desarrollan en los tramos medios cuando existen zonas de debilidad -fallas- que son aprovechadas por los cursos fluviales o bien cuando los materiales litológicos son deleznables.

Red de hoces fluviales en el curso del río Jalón y dos de sus afluentes, el Isuela y el Aranda. Relieves aledaños que superan los 1.100 metros en algunos sectores. Predominio de cubierta vegetal por matorrales, con muestras en algunas zonas de encinares. Sotos ribereños en el cauce de los ríos. Zonas de huertas y cultivos extensivos en las zonas favorables. Importantes poblaciones de rapaces rupícolas, con varias colonias de buitre leonado (Gyps fulvus) y varios territorios de águila azor perdicera​ (Hieraaetus fasciatus). Zona importante de águila real ibérica (Aquila chrysaetos) y halcón peregrino (Falco peregrinus). Varias parejas de alimoche (Nephron percnopterus) y posiblemente común el búho real (Bubo bubo). En muchas zonas es frecuente la collalba negra  (Oenanthe leucura). Abundantes, las especies del matorral, incluyendo la cogujada montesina (Galerida theklae), bisbita campestre​ (Anthus campestris) y curruca rabilarga (Sylvia undata). También es común la alondra totovía​ (Lullula arborea) en zonas arboladas.

Es este un espacio de gran variabilidad paisajística como consecuencia de la presencia de las sierras paleozoicas de la Cocha (1008 m.) y el cerro de los Pedrosos (1079 m.), y un sector del tramo medio del río Jalón, que secciona el espacio en dos partes, labrando un profundo cañón fluvial con meandros encajados. El río en este sector atraviesa, claramente inadaptado a las estructuras dominantes, las alineaciones montañosas con orientación de fluencia SE-NW. La excavación cuaternaria en el Valle del Jalón ha labrado profundas y sinuosas gargantas en los materiales resistentes del paleozoico. Es un río de régimen hídrico pluvial y puramente mediterráneo, con máximos de caudal equinociales y un marcado mínimo estival. En este sector recibe los aportes de numerosos barrancos laterales, destacando la rambla de Ribota, que discurre por materiales terciarios de naturaleza conglomerática y areniscosa, aportando gran cantidad de aluvión, o el barranco de San Blas.

En el fondo del valle aparecen depósitos aluviales poco desarrollados en este sector aprovechados para el asentamiento en franjas laterales de bosques galería en los que predominan chopos, álamos y sauces. Los terrenos de cultivo llegan en ocasiones hasta cerca del cauce, impidiendo la progresión de la vegetación ribereña. En las sierras laterales predomina un mosaico de matorral y herbazales en diferentes grados de madurez y cubrimiento. Junto a sectores con predominio de tomillar mixto y el lastón (Brachypodium retosum), encontramos zonas con Cervo-timo-aliagar. En otras zonas se desarrollan importantes carrascales. El pastoreo es la actividad más destacada, siendo importante en todo el sector y condicionando la progresión del matorral. En algunos sectores, la presencia abundante de ginestas (Retama sphaerocarpa) y (Cytisus scoparius) atestiguan este hecho.